Il est de plus en plus courant de publier un protocole de recherche au début d'une synthèse des connaissances. Il s'agit en effet d'une bonne pratique recommandée par les principales lignes directrices méthodologiques, tant pour les revues systématiques que les examens de la portée (scoping reviews).

Le protocole est un bref document (3 à 4 pages, parfois plus) remplissant plusieurs fonctions :

• Il annonce à la communauté scientifique le projet en cours (pour éviter le dédoublement des recherches).
• Il favorise la transparence et minimise le risque de biais en annonçant avant l'obtention des résultats quelle méthodologie et quels outils seront employés.
• Il sert de plan de travail pour l'équipe de recherche et de base pour la rédaction de l'article.
• Si le protocole est révisé par des pairs, il donne l'occasion de rajuster le tir avant d'entamer la collecte de données.
• Il peut être exigé par les éditeurs scientifiques (dont JBI et Cochrane).

Il arrive que des modifications soient apportées au protocole après sa diffusion. Ces modifications doivent alors être signalées et expliquées dans la publication finale.

Tout protocole devrait idéalement fournir les éléments d'information exigés par la norme PRISMA-P, y compris...

• La ou les questions de recherche;
• Les critères d'inclusion et d'exclusion;
• Les lignes directrices méthodologiques suivies;
• Une ébauche de stratégie de recherche documentaire;
• Les outils et processus qui seront utilisés aux différentes étapes de la synthèse des connaissances (recherche documentaire, tri des études, extraction des données, évaluation de la qualité méthodologique des études, synthèse des résultats, etc.);
• L'échéancier du projet.

Pour vous aider à rédiger votre protocole, consultez vos lignes directrices et/ou les ressources suivantes :

Pour publier un protocole, vérifiez d'abord si votre éditeur exige l'utilisation d'une plateforme spécifique.

Si le choix de la plateforme vous revient, vous avez différentes options, notamment :

• Des dépôts entièrement dédiés aux protocoles, comme PROSPERO (pour les sciences de la santé), PROCEED (pour les sciences de l'environnement), INPLASY (multidiscplinaire) et Protocols.io (multidisciplinaire);
• Des revues publiant des protocoles, comme Nature Protocols et Systematic Reviews;
• Des dépôts de publications généralistes comme Sémaphore (géré par la Bibliothèque de l'UQAR) et OSF Registries (utiliser le formulaire Generalized Systematic Review).

Note : les protocoles d'examens de la portée ne peuvent pas être diffusés dans PROSPERO, mais ils sont généralement admis sur les autres plateformes de dépôt.

Pour repérer des protocoles, vous pouvez effectuer des recherches sur les plateformes recommandées ci-dessus, ou encore passer par des bases de données bibliographiques (Web of Science, Scopus, etc.) ou des moteurs de recherche de publications scientifiques (Google Scholar, OpenAlex). Cherchez simplement « protocol », en plus des autres termes spécifiques à votre sujet de recherche.